depth_vs_coverage

depth、coverage这两个概念已经用混了,coverage的意义更广泛一些,还是需要区分一下的。
参考网址:https://www.biostars.org/p/638/
(1)理论上的倍数覆盖
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(2)理论上的广度覆盖
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(3)实际的深度覆盖
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感觉都不太准确,应该使用下面的计算方式计算测序深度(其实大同小异,只是更精确一点)
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并且
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所以
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参考文献
1988-Genomic Mapping by Fingerprinting Random Clones: A Mathematical Analysis
2014-Estimating Sequencing Coverage